76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1638 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  100 
 
 		 199 aa  394  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  56.36 
 
 		 331 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  59.12 
 
 		 345 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  60.69 
 
 		 334 aa  174  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2970  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  56.8 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  45.41 
 
 		 326 aa  157  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0887  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  43.55 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.389857  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  39.2 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5156  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  39.53 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.646144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3450  pH adaptation potassium efflux system protein B1 (sodium-potassium/hydrogen antiporter subunit B1)  39.38 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2164  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  46.34 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0841  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  36.09 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.77 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2583  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  38.95 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0505  hypothetical protein  34.18 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000123307  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  49.12 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0668  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  37.08 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  32.05 
 
 		 321 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0952  membrane bound hydrogenase subunit mbhE  41.89 
 
 		 94 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0538183  normal  0.154534 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.12 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.34 
 
 		 932 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  39.51 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  30.37 
 
 		 313 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  27.75 
 
 		 331 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.67 
 
 		 966 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.82 
 
 		 933 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  32.53 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  49.06 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 		 775 aa  48.5  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.36 
 
 		 931 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  36 
 
 		 81 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.69 
 
 		 943 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  52.5 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  29.9 
 
 		 964 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0208  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.61 
 
 		 1038 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  43.64 
 
 		 254 aa  47  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.14 
 
 		 933 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.4 
 
 		 967 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.57 
 
 		 931 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  26.22 
 
 		 796 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.92 
 
 		 947 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.48 
 
 		 930 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.85 
 
 		 933 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.59 
 
 		 938 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.69 
 
 		 788 aa  44.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.49 
 
 		 953 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  47.37 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1913  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25 
 
 		 935 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.73 
 
 		 953 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.58 
 
 		 801 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  31.39 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.58 
 
 		 801 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.97 
 
 		 997 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.57 
 
 		 943 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0667  hypothetical protein  41.38 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1729  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 		 946 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00755431  normal  0.268001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.84 
 
 		 930 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0914  hypothetical protein  36.51 
 
 		 83 aa  43.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000458716  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.54 
 
 		 801 aa  42.4  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.67 
 
 		 941 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.25 
 
 		 964 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.83 
 
 		 946 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.25 
 
 		 964 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  38.78 
 
 		 948 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  22.89 
 
 		 800 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  22.89 
 
 		 800 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1202  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.38 
 
 		 766 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00531047  hitchhiker  0.00103792 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1044  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  20.37 
 
 		 253 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.9 
 
 		 969 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.17 
 
 		 932 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.28 
 
 		 973 aa  41.6  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.81 
 
 		 957 aa  41.6  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 		 980 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.66 
 
 		 931 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  43.75 
 
 		 793 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.58 
 
 		 931 aa  41.2  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>