More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2806 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.67 
 
 
943 aa  802    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.39 
 
 
971 aa  1041    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.48 
 
 
964 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.25 
 
 
979 aa  1072    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.16 
 
 
930 aa  776    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  53.38 
 
 
930 aa  821    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  69.11 
 
 
972 aa  1293    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  59.9 
 
 
972 aa  1028    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  70.14 
 
 
967 aa  1346    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.46 
 
 
975 aa  1011    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.61 
 
 
984 aa  1105    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60 
 
 
972 aa  1030    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.21 
 
 
981 aa  1092    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.29 
 
 
971 aa  1038    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.51 
 
 
941 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.02 
 
 
931 aa  763    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.25 
 
 
969 aa  1068    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  62.8 
 
 
980 aa  1144    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.14 
 
 
931 aa  770    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.83 
 
 
966 aa  1064    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.27 
 
 
949 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.48 
 
 
964 aa  1080    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49 
 
 
943 aa  728    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.39 
 
 
949 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.92 
 
 
984 aa  1109    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.28 
 
 
931 aa  766    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.84 
 
 
947 aa  770    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.81 
 
 
971 aa  1040    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.97 
 
 
962 aa  1044    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  69.42 
 
 
971 aa  1281    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.1 
 
 
1024 aa  969    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.7 
 
 
971 aa  1050    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.61 
 
 
961 aa  675    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.34 
 
 
1006 aa  1076    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.99 
 
 
952 aa  711    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.56 
 
 
979 aa  1080    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.63 
 
 
958 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.16 
 
 
966 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.46 
 
 
969 aa  702    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.39 
 
 
992 aa  1132    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.08 
 
 
958 aa  688    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.46 
 
 
932 aa  708    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  62.62 
 
 
978 aa  1088    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  64.36 
 
 
973 aa  1207    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.78 
 
 
953 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  68.9 
 
 
970 aa  1290    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.27 
 
 
983 aa  1039    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50 
 
 
938 aa  768    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.63 
 
 
953 aa  726    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  64.1 
 
 
975 aa  1129    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.39 
 
 
933 aa  787    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.64 
 
 
933 aa  807    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.07 
 
 
949 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  100 
 
 
997 aa  1978    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.36 
 
 
933 aa  776    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.56 
 
 
975 aa  1056    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.7 
 
 
932 aa  783    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.89 
 
 
946 aa  636    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.67 
 
 
959 aa  1028    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.54 
 
 
931 aa  792    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.66 
 
 
790 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.3 
 
 
799 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 
792 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.32 
 
 
966 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.32 
 
 
966 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.32 
 
 
966 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  34.91 
 
 
1003 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 
790 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.53 
 
 
950 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.38 
 
 
767 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.08 
 
 
800 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.08 
 
 
800 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.49 
 
 
801 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.49 
 
 
801 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  35.37 
 
 
889 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.99 
 
 
800 aa  414  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.88 
 
 
769 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.58 
 
 
956 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  36.35 
 
 
980 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.66 
 
 
764 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.8 
 
 
1004 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.52 
 
 
968 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  35.48 
 
 
891 aa  412  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.74 
 
 
1014 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.46 
 
 
969 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.01 
 
 
766 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.08 
 
 
772 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.01 
 
 
768 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.05 
 
 
785 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.28 
 
 
767 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.87 
 
 
768 aa  402  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.35 
 
 
782 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.85 
 
 
765 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.39 
 
 
767 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.28 
 
 
911 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.62 
 
 
929 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624896  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.45 
 
 
786 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.49 
 
 
788 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.42 
 
 
801 aa  389  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2439  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.12 
 
 
1003 aa  389  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.508052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>