86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2970 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2970  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  56.14 
 
 		 331 aa  191  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0887  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  54.14 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.389857  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  54.7 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  56.94 
 
 		 334 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  53.9 
 
 		 345 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  54.02 
 
 		 326 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  43.68 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5156  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  38.46 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.646144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0841  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  40.7 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  36.6 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3450  pH adaptation potassium efflux system protein B1 (sodium-potassium/hydrogen antiporter subunit B1)  41.11 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0505  hypothetical protein  39.02 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000123307  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2164  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  40.24 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  40.79 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  35.1 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  41.1 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  38.93 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  36.62 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.8 
 
 		 930 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.95 
 
 		 964 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.03 
 
 		 1006 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  26.63 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.41 
 
 		 992 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0668  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  36.56 
 
 		 101 aa  52.4  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  58 
 
 		 980 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.9 
 
 		 997 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.95 
 
 		 331 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  58.33 
 
 		 233 aa  51.6  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.79 
 
 		 943 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  38.57 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.94 
 
 		 967 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  42.25 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  41.94 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0952  membrane bound hydrogenase subunit mbhE  37.5 
 
 		 94 aa  49.3  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0538183  normal  0.154534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 		 948 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.25 
 
 		 775 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30 
 
 		 971 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  33.66 
 
 		 796 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.84 
 
 		 932 aa  47.8  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.78 
 
 		 952 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.06 
 
 		 979 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.06 
 
 		 979 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.81 
 
 		 933 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2583  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  33.33 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 		 933 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.19 
 
 		 983 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0483  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.75 
 
 		 798 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.514379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.06 
 
 		 975 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.57 
 
 		 788 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.41 
 
 		 768 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.08 
 
 		 966 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  36.55 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  40.91 
 
 		 241 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 		 933 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.41 
 
 		 768 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.11 
 
 		 984 aa  45.4  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.9 
 
 		 969 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.77 
 
 		 984 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2709  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.9 
 
 		 786 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  42.37 
 
 		 254 aa  45.4  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.39 
 
 		 947 aa  45.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.56 
 
 		 943 aa  45.1  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.73 
 
 		 931 aa  45.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.86 
 
 		 981 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.67 
 
 		 931 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30340  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  30.06 
 
 		 784 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.6 
 
 		 957 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  28.66 
 
 		 790 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.49 
 
 		 971 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.49 
 
 		 971 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.32 
 
 		 953 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.49 
 
 		 971 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.03 
 
 		 931 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12090  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  31.51 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1800  NADH dehydrogenase (quinone)  38.46 
 
 		 941 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.80302  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.86 
 
 		 973 aa  42.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.07 
 
 		 972 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.55 
 
 		 781 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1913  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.23 
 
 		 935 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  32.94 
 
 		 793 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0383  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.4  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00717721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.73 
 
 		 953 aa  41.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.81 
 
 		 972 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.15 
 
 		 790 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  27.81 
 
 		 972 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>