121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0952 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0952  membrane bound hydrogenase subunit mbhE  100 
 
 
94 aa  187  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0538183  normal  0.154534 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2583  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  48.84 
 
 
94 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0668  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  57.81 
 
 
101 aa  82  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  50 
 
 
796 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  38.2 
 
 
242 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.98 
 
 
788 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.02 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  38.89 
 
 
241 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.37 
 
 
932 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0505  hypothetical protein  34.21 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000123307  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  41.89 
 
 
199 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.86 
 
 
933 aa  53.9  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2164  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  37.35 
 
 
97 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  36.25 
 
 
233 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  54.17 
 
 
980 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  42 
 
 
241 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.64 
 
 
1006 aa  52.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.23 
 
 
932 aa  52  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  54.76 
 
 
943 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  58.97 
 
 
241 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  54.55 
 
 
953 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  48.94 
 
 
790 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50 
 
 
931 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.86 
 
 
930 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.1 
 
 
930 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  50 
 
 
239 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  55.81 
 
 
947 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
967 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48 
 
 
966 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.64 
 
 
984 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.64 
 
 
984 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50 
 
 
931 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46 
 
 
1024 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
948 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 
793 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.07 
 
 
941 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2970  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  37.5 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.130344 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  54.76 
 
 
931 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46 
 
 
966 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.4 
 
 
799 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.62 
 
 
959 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.5 
 
 
949 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.28 
 
 
933 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  47.06 
 
 
241 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  41.67 
 
 
334 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  41.67 
 
 
345 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.9 
 
 
975 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
981 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  44 
 
 
254 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  45.83 
 
 
964 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
971 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.28 
 
 
933 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.29 
 
 
973 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.6 
 
 
975 aa  47.4  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
971 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
971 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.5 
 
 
949 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.5 
 
 
949 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
979 aa  47  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
979 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.29 
 
 
972 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.86 
 
 
980 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.5 
 
 
978 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42 
 
 
983 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.86 
 
 
997 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.16 
 
 
768 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.16 
 
 
768 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.07 
 
 
971 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5156  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  37.29 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.646144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.45 
 
 
931 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.83 
 
 
962 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 
792 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  41.67 
 
 
331 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.5 
 
 
975 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.11 
 
 
790 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.75 
 
 
964 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.75 
 
 
964 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  38.82 
 
 
178 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  42 
 
 
972 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50 
 
 
946 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.29 
 
 
970 aa  44.7  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  43.64 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  42.86 
 
 
767 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1783  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  54.29 
 
 
253 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  54.29 
 
 
253 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000846498 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1044  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  54.29 
 
 
253 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.75 
 
 
971 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.68 
 
 
992 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40 
 
 
972 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5101  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  58.82 
 
 
267 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.11 
 
 
969 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  36.99 
 
 
313 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1913  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38 
 
 
935 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  38.33 
 
 
326 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50 
 
 
953 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0887  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  32.1 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.389857  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3148  NADH dehydrogenase (quinone)  36 
 
 
760 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  54.29 
 
 
254 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  54.29 
 
 
272 aa  42.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.86 
 
 
943 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>