84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5101 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5101  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  100 
 
 		 267 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0683  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  60.16 
 
 		 258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1675  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  39.75 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  27.24 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  31.95 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.15 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.15 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.67 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.83 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.77 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.53 
 
 		 943 aa  65.5  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1044  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.22 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.92 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000846498 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1783  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.22 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.06 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.39 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.32 
 
 		 958 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.45 
 
 		 930 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.15 
 
 		 958 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.25 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.9 
 
 		 943 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.84 
 
 		 931 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.38 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0751622  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0669  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.2 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.91 
 
 		 953 aa  55.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.22 
 
 		 941 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.36 
 
 		 933 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.86 
 
 		 932 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.9 
 
 		 931 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.36 
 
 		 933 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.17 
 
 		 933 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1800  NADH dehydrogenase (quinone)  30.32 
 
 		 941 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.80302  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 		 947 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.97 
 
 		 961 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.78 
 
 		 946 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.17 
 
 		 334 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.85 
 
 		 969 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  35.14 
 
 		 980 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.11 
 
 		 952 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.48 
 
 		 930 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25200  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  26.53 
 
 		 981 aa  49.7  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.03 
 
 		 931 aa  49.3  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  31.58 
 
 		 891 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.27 
 
 		 968 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2583  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  38.55 
 
 		 94 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  30.43 
 
 		 889 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1168  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.61 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.574508  normal  0.691996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.52 
 
 		 966 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.98 
 
 		 975 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.41 
 
 		 966 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0668  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  34.69 
 
 		 101 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3449  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  37.14 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.339859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.77 
 
 		 929 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  33.61 
 
 		 964 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3548  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.16 
 
 		 219 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169533  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.41 
 
 		 966 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.41 
 
 		 966 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.62 
 
 		 938 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.48 
 
 		 953 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.86 
 
 		 931 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.3 
 
 		 969 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0046  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.2 
 
 		 937 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.504541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2584  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  37.18 
 
 		 159 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.14 
 
 		 992 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0494  NADH dehydrogenase (quinone)  30.08 
 
 		 958 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1355  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.14 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252936  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1214  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.59 
 
 		 239 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.57 
 
 		 949 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2861  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.06 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.76956 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0952  membrane bound hydrogenase subunit mbhE  36.78 
 
 		 94 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0538183  normal  0.154534 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.41 
 
 		 999 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.95 
 
 		 949 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.37 
 
 		 1024 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.91 
 
 		 975 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.06 
 
 		 949 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.46 
 
 		 932 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0505  hypothetical protein  32.47 
 
 		 93 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000123307  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5155  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  33.33 
 
 		 172 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.46 
 
 		 973 aa  43.1  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2566  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  28.19 
 
 		 220 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.74 
 
 		 981 aa  42.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  31.9 
 
 		 906 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 		 948 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>