More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0676 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.61 
 
 		 984 aa  717    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.64 
 
 		 949 aa  965    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.35 
 
 		 971 aa  700    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.96 
 
 		 979 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.19 
 
 		 930 aa  789    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.91 
 
 		 975 aa  718    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.92 
 
 		 972 aa  736    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  45.93 
 
 		 972 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.09 
 
 		 931 aa  773    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.54 
 
 		 967 aa  728    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.79 
 
 		 962 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.95 
 
 		 932 aa  829    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  53.13 
 
 		 933 aa  799    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.14 
 
 		 972 aa  718    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.88 
 
 		 969 aa  732    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.12 
 
 		 997 aa  732    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.19 
 
 		 941 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.53 
 
 		 931 aa  711    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.92 
 
 		 970 aa  734    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.22 
 
 		 980 aa  695    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.87 
 
 		 975 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.02 
 
 		 966 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.85 
 
 		 949 aa  967    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.08 
 
 		 964 aa  675    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.5 
 
 		 947 aa  773    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.1 
 
 		 943 aa  720    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.65 
 
 		 975 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  53.89 
 
 		 930 aa  843    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.76 
 
 		 931 aa  771    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.51 
 
 		 1024 aa  728    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.07 
 
 		 953 aa  1052    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  87.06 
 
 		 961 aa  1472    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.21 
 
 		 952 aa  1067    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.27 
 
 		 973 aa  699    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  84.85 
 
 		 958 aa  1509    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.8 
 
 		 966 aa  774    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.19 
 
 		 969 aa  1013    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.45 
 
 		 992 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  100 
 
 		 958 aa  1859    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.27 
 
 		 932 aa  771    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.5 
 
 		 978 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.59 
 
 		 953 aa  972    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.65 
 
 		 971 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.73 
 
 		 983 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.67 
 
 		 971 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  52.79 
 
 		 943 aa  776    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.35 
 
 		 981 aa  739    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  53.72 
 
 		 933 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.8 
 
 		 971 aa  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.96 
 
 		 979 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.15 
 
 		 938 aa  681    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.19 
 
 		 964 aa  676    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.96 
 
 		 949 aa  970    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.66 
 
 		 946 aa  938    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.12 
 
 		 959 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.14 
 
 		 931 aa  803    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  50.74 
 
 		 933 aa  804    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.71 
 
 		 984 aa  718    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.53 
 
 		 1006 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.65 
 
 		 971 aa  702    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.32 
 
 		 772 aa  475  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  41.74 
 
 		 792 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  42.88 
 
 		 790 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.38 
 
 		 766 aa  462  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.99 
 
 		 790 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.14 
 
 		 799 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  38.26 
 
 		 889 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.81 
 
 		 767 aa  452  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.42 
 
 		 770 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  37.78 
 
 		 891 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.9 
 
 		 764 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.41 
 
 		 801 aa  428  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  40.76 
 
 		 793 aa  429  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.15 
 
 		 1014 aa  429  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.29 
 
 		 966 aa  426  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.29 
 
 		 966 aa  426  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.29 
 
 		 966 aa  426  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.16 
 
 		 801 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.59 
 
 		 768 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  35.74 
 
 		 1003 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.59 
 
 		 768 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.1 
 
 		 968 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.16 
 
 		 801 aa  422  1e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.25 
 
 		 767 aa  420  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.3 
 
 		 950 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  38.56 
 
 		 948 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.94 
 
 		 769 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.35 
 
 		 800 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.83 
 
 		 785 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.1 
 
 		 786 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.4 
 
 		 792 aa  419  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.35 
 
 		 1004 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.41 
 
 		 911 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 		 906 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.24 
 
 		 800 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.44 
 
 		 956 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.24 
 
 		 800 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.76 
 
 		 999 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.45 
 
 		 765 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.29 
 
 		 767 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>