More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0671 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3714  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  56.99 
 
 
967 aa  957    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0350  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.75 
 
 
982 aa  678    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.92 
 
 
968 aa  998    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.01 
 
 
929 aa  689    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624896  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2439  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.65 
 
 
1003 aa  668    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.508052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0494  NADH dehydrogenase (quinone)  50.75 
 
 
958 aa  759    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
950 aa  1875    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.21 
 
 
956 aa  689    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25200  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  42.78 
 
 
981 aa  653    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35460  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  45.41 
 
 
1021 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.917594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18970  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  46.75 
 
 
1032 aa  686    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0046  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.51 
 
 
937 aa  672    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.504541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.36 
 
 
966 aa  976    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4894  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.76 
 
 
986 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155841  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.59 
 
 
999 aa  758    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  44.81 
 
 
1003 aa  707    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.36 
 
 
966 aa  976    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.44 
 
 
1004 aa  752    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.88 
 
 
1014 aa  744    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0208  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.7 
 
 
1038 aa  645    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.36 
 
 
966 aa  976    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.41 
 
 
969 aa  983    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3187  NADH dehydrogenase (quinone)  46.12 
 
 
979 aa  616  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05150  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  44.67 
 
 
978 aa  609  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  43.99 
 
 
980 aa  604  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  43.98 
 
 
796 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.06 
 
 
983 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.06 
 
 
966 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.26 
 
 
952 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.74 
 
 
997 aa  439  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.86 
 
 
992 aa  439  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.14 
 
 
969 aa  436  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.88 
 
 
932 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.04 
 
 
971 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.62 
 
 
930 aa  423  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  35.84 
 
 
972 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.15 
 
 
953 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.74 
 
 
972 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.13 
 
 
971 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.73 
 
 
967 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.07 
 
 
971 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.07 
 
 
930 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.05 
 
 
972 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.9 
 
 
981 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.96 
 
 
971 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.93 
 
 
932 aa  415  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.05 
 
 
970 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.65 
 
 
1006 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.54 
 
 
933 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.62 
 
 
984 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.07 
 
 
971 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.28 
 
 
931 aa  414  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.48 
 
 
943 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.51 
 
 
984 aa  412  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.76 
 
 
969 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.89 
 
 
933 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.48 
 
 
943 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.39 
 
 
975 aa  406  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.2 
 
 
958 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.12 
 
 
931 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.16 
 
 
959 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.58 
 
 
973 aa  396  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.65 
 
 
966 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.5 
 
 
941 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.92 
 
 
975 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.71 
 
 
931 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.87 
 
 
964 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.29 
 
 
958 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.91 
 
 
953 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.87 
 
 
964 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.25 
 
 
946 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.51 
 
 
933 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.92 
 
 
938 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.78 
 
 
947 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.97 
 
 
961 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.31 
 
 
962 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.7 
 
 
979 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.59 
 
 
979 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.9 
 
 
975 aa  379  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.08 
 
 
980 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.13 
 
 
1024 aa  376  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  34.14 
 
 
889 aa  372  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.31 
 
 
949 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.73 
 
 
799 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.49 
 
 
949 aa  365  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.98 
 
 
931 aa  364  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.38 
 
 
949 aa  363  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  34.31 
 
 
792 aa  362  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.2 
 
 
772 aa  360  7e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  32.82 
 
 
891 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  32.38 
 
 
906 aa  354  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.69 
 
 
767 aa  353  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.89 
 
 
801 aa  352  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.65 
 
 
978 aa  352  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1913  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.47 
 
 
935 aa  352  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.69 
 
 
765 aa  351  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.67 
 
 
790 aa  350  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.77 
 
 
770 aa  345  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.62 
 
 
785 aa  344  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.42 
 
 
769 aa  344  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>