More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5156 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.29 
 
 
971 aa  964    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.88 
 
 
930 aa  733    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  94.28 
 
 
979 aa  1716    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.68 
 
 
972 aa  1099    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.83 
 
 
975 aa  954    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  57.07 
 
 
972 aa  958    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.17 
 
 
969 aa  1007    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  100 
 
 
975 aa  1915    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.19 
 
 
964 aa  998    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  61.02 
 
 
975 aa  1031    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.96 
 
 
972 aa  957    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.97 
 
 
962 aa  960    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.29 
 
 
967 aa  1120    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  51.04 
 
 
943 aa  823    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.67 
 
 
941 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.14 
 
 
973 aa  1048    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.23 
 
 
931 aa  703    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.54 
 
 
984 aa  1016    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.73 
 
 
980 aa  1044    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.74 
 
 
983 aa  973    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.74 
 
 
931 aa  731    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  55.82 
 
 
966 aa  978    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.19 
 
 
964 aa  998    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.58 
 
 
970 aa  1095    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.17 
 
 
947 aa  716    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.8 
 
 
953 aa  717    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.01 
 
 
971 aa  970    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  55.12 
 
 
1024 aa  942    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.23 
 
 
984 aa  1012    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.21 
 
 
952 aa  696    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  58.95 
 
 
1006 aa  1003    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.82 
 
 
958 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.55 
 
 
966 aa  702    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  94.39 
 
 
979 aa  1717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.33 
 
 
933 aa  728    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.63 
 
 
958 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.19 
 
 
971 aa  964    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.74 
 
 
932 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  59.33 
 
 
978 aa  992    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.11 
 
 
932 aa  756    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.61 
 
 
930 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.75 
 
 
981 aa  1018    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  62.29 
 
 
971 aa  1111    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.89 
 
 
938 aa  758    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.96 
 
 
933 aa  741    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.29 
 
 
933 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  56.99 
 
 
971 aa  957    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  60.56 
 
 
997 aa  1112    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  48.49 
 
 
931 aa  698    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  57.02 
 
 
992 aa  1024    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.35 
 
 
969 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  55.57 
 
 
959 aa  971    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49 
 
 
943 aa  727    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  47.08 
 
 
931 aa  736    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.72 
 
 
961 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.03 
 
 
949 aa  635  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.51 
 
 
953 aa  632  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.7 
 
 
949 aa  616  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.7 
 
 
949 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.46 
 
 
946 aa  619  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.08 
 
 
799 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.97 
 
 
790 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.27 
 
 
801 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.88 
 
 
788 aa  433  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0281  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.17 
 
 
800 aa  432  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305042  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  36.35 
 
 
889 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.02 
 
 
801 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.02 
 
 
801 aa  429  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.55 
 
 
1004 aa  428  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.96 
 
 
800 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.96 
 
 
800 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.09 
 
 
999 aa  422  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  34.8 
 
 
1003 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.41 
 
 
767 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.65 
 
 
966 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  38.16 
 
 
980 aa  418  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.65 
 
 
966 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.65 
 
 
966 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  38.65 
 
 
790 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.57 
 
 
768 aa  416  1e-114  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.57 
 
 
768 aa  416  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.28 
 
 
968 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.72 
 
 
769 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.55 
 
 
950 aa  409  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.16 
 
 
1014 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 
793 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.39 
 
 
956 aa  399  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.99 
 
 
772 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.49 
 
 
957 aa  396  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.99 
 
 
782 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.43 
 
 
770 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  35.06 
 
 
891 aa  389  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  38.37 
 
 
948 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.24 
 
 
764 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.55 
 
 
767 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2439  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.3 
 
 
1003 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.508052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.89 
 
 
969 aa  386  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25200  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  35.22 
 
 
981 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.61 
 
 
792 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.37 
 
 
929 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624896  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>