More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0162  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.51 
 
 
968 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.01 
 
 
929 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624896  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  100 
 
 
1003 aa  1972    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0494  NADH dehydrogenase (quinone)  48.5 
 
 
958 aa  691    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.2 
 
 
1004 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05150  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  51.5 
 
 
978 aa  756    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0350  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.9 
 
 
982 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2439  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.87 
 
 
1003 aa  725    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.508052 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4894  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.38 
 
 
986 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155841  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0046  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  49.64 
 
 
937 aa  689    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.504541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3714  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.13 
 
 
967 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46 
 
 
956 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35460  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  45.89 
 
 
1021 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.917594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0208  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.94 
 
 
1038 aa  643    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  44.59 
 
 
950 aa  710    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25200  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  45.47 
 
 
981 aa  660    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.79 
 
 
966 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.99 
 
 
999 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.6 
 
 
1014 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3187  NADH dehydrogenase (quinone)  47.2 
 
 
979 aa  642    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.79 
 
 
966 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.79 
 
 
966 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.1 
 
 
969 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18970  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  44.13 
 
 
1032 aa  634  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  41.72 
 
 
980 aa  565  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  43.4 
 
 
796 aa  489  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.36 
 
 
952 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.58 
 
 
997 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.33 
 
 
959 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  37.55 
 
 
792 aa  432  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.54 
 
 
992 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.06 
 
 
930 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.82 
 
 
946 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.11 
 
 
943 aa  419  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.72 
 
 
969 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.58 
 
 
953 aa  416  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.17 
 
 
931 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.66 
 
 
966 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.51 
 
 
930 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.28 
 
 
971 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.16 
 
 
953 aa  406  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.4 
 
 
932 aa  406  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.43 
 
 
966 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  35.89 
 
 
793 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.94 
 
 
764 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.09 
 
 
972 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.22 
 
 
967 aa  399  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  34.03 
 
 
889 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.2 
 
 
947 aa  399  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.61 
 
 
983 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.06 
 
 
933 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.29 
 
 
981 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.85 
 
 
980 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.87 
 
 
970 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.06 
 
 
975 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.44 
 
 
943 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.52 
 
 
979 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.41 
 
 
969 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.73 
 
 
964 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.66 
 
 
964 aa  389  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.17 
 
 
1024 aa  387  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.78 
 
 
788 aa  388  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.41 
 
 
979 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.54 
 
 
972 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.71 
 
 
941 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.9 
 
 
984 aa  386  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.08 
 
 
975 aa  385  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.76 
 
 
984 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.55 
 
 
958 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.81 
 
 
932 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.35 
 
 
765 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  35.03 
 
 
972 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.14 
 
 
975 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.6 
 
 
931 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.96 
 
 
790 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.48 
 
 
933 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.96 
 
 
1006 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.89 
 
 
801 aa  379  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.22 
 
 
973 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.55 
 
 
933 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.17 
 
 
931 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  34.48 
 
 
891 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.12 
 
 
801 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.59 
 
 
781 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.43 
 
 
949 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.87 
 
 
962 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.12 
 
 
801 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.64 
 
 
799 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.27 
 
 
958 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.39 
 
 
769 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.42 
 
 
949 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.47 
 
 
931 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.01 
 
 
767 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0607  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.4 
 
 
791 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.56 
 
 
768 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.56 
 
 
768 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.95 
 
 
971 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.48 
 
 
961 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.86 
 
 
971 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.23 
 
 
785 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>