More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1433 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
906 aa  1739    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  66.48 
 
 
911 aa  1014    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.12 
 
 
782 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000418  Na(+) H(+) antiporter subunit A/Na(+) H(+) antiporter subunit B  42.42 
 
 
889 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2855  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.21 
 
 
769 aa  542  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  43.92 
 
 
792 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0074  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.16 
 
 
765 aa  530  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.89 
 
 
785 aa  529  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1121  putative NADH dehydrogenase  43.06 
 
 
891 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.49523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0748  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.57 
 
 
767 aa  522  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.114554  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.92 
 
 
768 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.84 
 
 
768 aa  517  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.51 
 
 
781 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  46.37 
 
 
764 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2102  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
793 aa  510  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2090  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.83 
 
 
770 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  44.4 
 
 
767 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2035  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.37 
 
 
772 aa  503  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0607  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.27 
 
 
791 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0874  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  45.85 
 
 
786 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.755571  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0094  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.99 
 
 
765 aa  495  9.999999999999999e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.527296  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  43.49 
 
 
790 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  43.54 
 
 
792 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0977  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.76 
 
 
767 aa  477  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.878835  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0870  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  46.44 
 
 
775 aa  476  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.867337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.98 
 
 
827 aa  473  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.95 
 
 
953 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.56 
 
 
952 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2529  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  42.12 
 
 
766 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.997639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.36 
 
 
999 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.35 
 
 
969 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.42 
 
 
930 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.4 
 
 
966 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  40.23 
 
 
933 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.79 
 
 
992 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  41.23 
 
 
931 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  36.15 
 
 
1003 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2806  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.58 
 
 
997 aa  442  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.448623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.53 
 
 
932 aa  438  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.83 
 
 
790 aa  439  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.6 
 
 
947 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.02 
 
 
953 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.57 
 
 
943 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0728  quinone dependent NADH dehydrogenase  44.47 
 
 
746 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.42 
 
 
972 aa  432  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.39 
 
 
949 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.01 
 
 
966 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.84 
 
 
949 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.42 
 
 
970 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.23 
 
 
958 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.74 
 
 
983 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.34 
 
 
967 aa  429  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.49 
 
 
975 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.16 
 
 
946 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.63 
 
 
959 aa  429  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.79 
 
 
958 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.49 
 
 
932 aa  424  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.61 
 
 
949 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.96 
 
 
933 aa  426  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.93 
 
 
931 aa  422  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3531  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.24 
 
 
971 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.25 
 
 
971 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.01 
 
 
930 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.02 
 
 
969 aa  419  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.76 
 
 
938 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.89 
 
 
931 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.22 
 
 
801 aa  415  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.23 
 
 
943 aa  416  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.78 
 
 
979 aa  412  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.58 
 
 
971 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  39.25 
 
 
933 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.78 
 
 
979 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0132  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.14 
 
 
788 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.27 
 
 
950 aa  410  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.35 
 
 
981 aa  412  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.98 
 
 
964 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.89 
 
 
799 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.03 
 
 
971 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.98 
 
 
964 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.38 
 
 
971 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.75 
 
 
980 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.34 
 
 
1024 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.31 
 
 
969 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.81 
 
 
972 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  38.72 
 
 
941 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6655  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  37.1 
 
 
929 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624896  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.02 
 
 
1004 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1010  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.84 
 
 
978 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.44 
 
 
1014 aa  402  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1913  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.8 
 
 
935 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.09 
 
 
801 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  36.6 
 
 
972 aa  399  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.66 
 
 
975 aa  399  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.1 
 
 
966 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.58 
 
 
984 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.1 
 
 
966 aa  399  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.51 
 
 
1006 aa  399  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.09 
 
 
801 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  36.47 
 
 
984 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0030  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.98 
 
 
973 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>