82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0841 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0841  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  100 
 
 
199 aa  385  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5156  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  60.69 
 
 
179 aa  181  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.646144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3450  pH adaptation potassium efflux system protein B1 (sodium-potassium/hydrogen antiporter subunit B1)  55.25 
 
 
185 aa  167  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  51.41 
 
 
178 aa  148  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.94 
 
 
181 aa  106  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  39.39 
 
 
326 aa  94.4  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1638  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  36.09 
 
 
199 aa  91.7  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2970  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  41.81 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.130344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0887  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  34.66 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.389857  normal  0.106971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.59 
 
 
331 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.9 
 
 
334 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.21 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  50.7 
 
 
81 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1163  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.12 
 
 
790 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.76 
 
 
964 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12090  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  38.96 
 
 
80 aa  59.7  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1775  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.39 
 
 
768 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.671135  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0400  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.39 
 
 
768 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0971  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.41 
 
 
801 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0952  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.41 
 
 
801 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.31 
 
 
1006 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.222898  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2164  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  39.39 
 
 
97 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.54 
 
 
331 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3218  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.3 
 
 
767 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0538  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.14 
 
 
801 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0914  hypothetical protein  35.59 
 
 
83 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0607  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.13 
 
 
791 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.36 
 
 
992 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  33.79 
 
 
313 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.77 
 
 
938 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0505  hypothetical protein  34.25 
 
 
93 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000123307  hitchhiker  0.0000653225 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.26 
 
 
967 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2922  NADH dehydrogenase (quinone)  28.99 
 
 
790 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.529423  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2666  hypothetical protein  41.25 
 
 
94 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5081  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.38 
 
 
979 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.71 
 
 
950 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4616  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.38 
 
 
979 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.641343  decreased coverage  0.000524948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2874  monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.76 
 
 
799 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5156  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.75 
 
 
975 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.88 
 
 
932 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0864  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.75 
 
 
781 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16800  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  28.74 
 
 
1003 aa  48.5  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.925776  normal  0.0481404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  32.91 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.42 
 
 
983 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.17 
 
 
952 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.7 
 
 
930 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1768  NADH dehydrogenase (quinone)  31.01 
 
 
792 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.78 
 
 
999 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.283218  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.59 
 
 
943 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2344  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.5 
 
 
764 aa  46.2  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.7 
 
 
943 aa  46.2  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3531  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.03 
 
 
827 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.247044  normal  0.586279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1112  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.11 
 
 
911 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.726371  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  31.68 
 
 
321 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1386  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.21 
 
 
984 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0924669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2474  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.21 
 
 
984 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.585409  normal  0.405301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.31 
 
 
946 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  25.71 
 
 
304 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1433  NADH dehydrogenase (quinone)  27.91 
 
 
906 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.548118  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1285  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.26 
 
 
792 aa  45.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1538  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.51 
 
 
953 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30 
 
 
957 aa  45.1  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.85 
 
 
962 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2439  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.15 
 
 
1003 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.508052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.91 
 
 
953 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0667  hypothetical protein  37.5 
 
 
84 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  25.99 
 
 
980 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30340  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  28.48 
 
 
784 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1000  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.97 
 
 
785 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1800  NADH dehydrogenase (quinone)  29.11 
 
 
941 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.80302  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.28 
 
 
964 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0952  membrane bound hydrogenase subunit mbhE  35.44 
 
 
94 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0538183  normal  0.154534 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  34.25 
 
 
242 aa  42.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.28 
 
 
964 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3695  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.32 
 
 
782 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.983526 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0383  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  42.7  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00717721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
931 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2928  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 
948 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1610  hypothetical protein  46.55 
 
 
80 aa  42  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00638305  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.66 
 
 
969 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2583  membrane bound hydrogenase, MbhE subunit  32.94 
 
 
94 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.32 
 
 
981 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>