21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2666 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2666  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  176  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  68.83 
 
 
331 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  56.32 
 
 
321 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2738  hypothetical protein  54.26 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.51828  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1284  hypothetical protein  59.76 
 
 
96 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1394  hypothetical protein  59.32 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  71.11 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  49.15 
 
 
81 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  47.14 
 
 
313 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3450  pH adaptation potassium efflux system protein B1 (sodium-potassium/hydrogen antiporter subunit B1)  48.53 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0914  hypothetical protein  38.6 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  41.07 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1584  hypothetical protein  50 
 
 
310 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12090  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  31.17 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110798  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.17 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  40.48 
 
 
326 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0894  hypothetical protein  27.94 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.141674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01580  hypothetical protein  57.14 
 
 
334 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933038  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  37.7 
 
 
334 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1745  hypothetical protein  30 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0887  putative multicomponent Na+-H+ antiporter subunit A  34.62 
 
 
189 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.389857  normal  0.106971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>