19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1394 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  206  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2738  hypothetical protein  71.15 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.51828  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  60.71 
 
 		 331 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2666  hypothetical protein  55.17 
 
 		 94 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  54.55 
 
 		 321 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1284  hypothetical protein  47.06 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  58.21 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  47.22 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  37.18 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0914  hypothetical protein  41.51 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1584  hypothetical protein  57.14 
 
 		 310 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3450  pH adaptation potassium efflux system protein B1 (sodium-potassium/hydrogen antiporter subunit B1)  48.21 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12090  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  30.14 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01580  hypothetical protein  67.74 
 
 		 334 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2860  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  36.51 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.795872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0667  hypothetical protein  43.64 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0558  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.72 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1745  hypothetical protein  34.78 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  42.62 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>