64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01580  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  603  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  45.05 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  41.81 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  38.13 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  36.57 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1584  hypothetical protein  35.11 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  37.79 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1395  hypothetical protein  39.06 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.9 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.08 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2665  hypothetical protein  38.55 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  30.94 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.33 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2666  hypothetical protein  44.94 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.19 
 
 		 931 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.23 
 
 		 241 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.69 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.97 
 
 		 233 aa  53.1  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2738  hypothetical protein  49.09 
 
 		 110 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.51828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.36 
 
 		 932 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.63 
 
 		 969 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.93 
 
 		 241 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.58 
 
 		 933 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0744  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.4 
 
 		 969 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.35 
 
 		 931 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.45 
 
 		 943 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.59 
 
 		 957 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3449  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  26.67 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.339859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.05 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.7 
 
 		 933 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0660  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  24.34 
 
 		 800 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0122576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0645  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  24.34 
 
 		 800 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.04 
 
 		 953 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1394  hypothetical protein  47.27 
 
 		 107 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.39 
 
 		 933 aa  47  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.23 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000846498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.21 
 
 		 930 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3443  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.89 
 
 		 971 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.274222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.54 
 
 		 943 aa  46.2  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0576  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.84 
 
 		 966 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0598  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.84 
 
 		 966 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581873  normal  0.957162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0586  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.84 
 
 		 966 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4630  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.29 
 
 		 1040 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.87 
 
 		 930 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  28.48 
 
 		 972 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 		 980 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.16 
 
 		 932 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.4 
 
 		 966 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.41 
 
 		 971 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.15 
 
 		 971 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1044  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.74 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.14 
 
 		 972 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.41 
 
 		 971 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14740  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  35.38 
 
 		 796 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.413195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1783  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  28.21 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.17 
 
 		 1024 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0504  putative multicomponent Na+:H+ antiporter subunit B  34.25 
 
 		 81 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000000912266  hitchhiker  0.000130632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1406  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.84 
 
 		 200 aa  43.9  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.186754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3128  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.53 
 
 		 975 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.69 
 
 		 946 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0683  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  26.61 
 
 		 258 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.71 
 
 		 949 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  32 
 
 		 242 aa  42.7  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>