87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2665 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2665  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  68.78 
 
 
331 aa  264  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  48 
 
 
218 aa  147  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1395  hypothetical protein  48.28 
 
 
218 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  39.13 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1584  hypothetical protein  44.79 
 
 
310 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  43.55 
 
 
321 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  44.54 
 
 
317 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1283  hypothetical protein  45.66 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  28.14 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.9 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.35 
 
 
326 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.58 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  32.1 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  34.9 
 
 
943 aa  65.5  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0915  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  25 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0114255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2969  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.95 
 
 
145 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01580  hypothetical protein  39.66 
 
 
334 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933038  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  31.76 
 
 
254 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0888  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.07 
 
 
152 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.176778  normal  0.107899 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  29.55 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  34.9 
 
 
980 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0893  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  24.84 
 
 
241 aa  55.1  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.272819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12080  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.66 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2484  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.37 
 
 
931 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0697  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.66 
 
 
946 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.156614  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1637  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  34.38 
 
 
138 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.948453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1524  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.79 
 
 
981 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0557  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.47 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0382  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  28.79 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00459549  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.74 
 
 
952 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.593151  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3805  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.89 
 
 
969 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.761799 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2849  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.33 
 
 
933 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3857  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.03 
 
 
958 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.08 
 
 
992 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431128  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3729  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.97 
 
 
943 aa  49.3  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04209  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  35.23 
 
 
938 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1842  hypothetical protein  39.13 
 
 
304 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0063  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.57 
 
 
947 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0903  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.67 
 
 
932 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0217477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2652  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.15 
 
 
949 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26930  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhA subunit  32.74 
 
 
964 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0148586  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0992  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.33 
 
 
949 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1441  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.82 
 
 
930 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.963541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0676  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.67 
 
 
958 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.685359  normal  0.485202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3909  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.8 
 
 
975 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0232  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.33 
 
 
949 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  0.778843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0671  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.89 
 
 
950 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0582  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.67 
 
 
966 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.041044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3818  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.07 
 
 
930 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2163  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  32.97 
 
 
143 aa  45.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3714  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.71 
 
 
967 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1100  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.56 
 
 
953 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0546017  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0500  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.83 
 
 
972 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438717  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3625  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.85 
 
 
962 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19530  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  33.33 
 
 
931 aa  45.1  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1044  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.57 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3950  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.83 
 
 
956 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0588976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50730  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.64 
 
 
933 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.284613  normal  0.0126871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4324  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.63 
 
 
933 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4630  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.97 
 
 
1040 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0435  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.08 
 
 
970 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.305696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3471  monovalent cation:proton antiporter, putative  26.38 
 
 
972 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.665295  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0497  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32.28 
 
 
931 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.999924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5269  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.55 
 
 
967 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2654  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.17 
 
 
980 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1605  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.15 
 
 
983 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1591  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.68 
 
 
1024 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3252  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  26.99 
 
 
972 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295044  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1359  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.36 
 
 
931 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.472017  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  35.29 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0751622  normal  0.115987 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3449  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.69 
 
 
964 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.58933 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3715  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  27.69 
 
 
964 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.982379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0873  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25.87 
 
 
253 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000846498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1289  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.19 
 
 
959 aa  42.4  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1678  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  31.01 
 
 
941 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0148  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.39 
 
 
961 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525301  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0935  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  23.96 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3982  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  28.95 
 
 
932 aa  42  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.728427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1783  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  25 
 
 
253 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2861  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  29.7 
 
 
154 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.76956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11050  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  29.67 
 
 
957 aa  42  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.217743  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2445  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.95 
 
 
969 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3510  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.15 
 
 
971 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00329797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3310  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  30.33 
 
 
966 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90946  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1853  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.15 
 
 
971 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.126065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2230  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  25.15 
 
 
971 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>