19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1283 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1283  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1003  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  44.68 
 
 		 331 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2739  hypothetical protein  45.93 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2665  hypothetical protein  45.66 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1395  hypothetical protein  41.45 
 
 		 218 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1035  hypothetical protein  40.34 
 
 		 313 aa  92  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0509685 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0741  hypothetical protein  38.89 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0815  hypothetical protein  32.86 
 
 		 321 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1584  hypothetical protein  39.39 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3951  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  26.75 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3282  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  27.2 
 
 		 345 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000131968  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3664  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  24.4 
 
 		 334 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.182615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0578  Na+/H+ antiporter MnhB subunit-related protein  30.21 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1130  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit A  32 
 
 		 943 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01580  hypothetical protein  36.15 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5214  NADH dehydrogenase (quinone)  33.91 
 
 		 980 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1406  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.69 
 
 		 200 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2212  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  33.33 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.576042  normal  0.0812259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1609  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit B  30.66 
 
 		 254 aa  41.6  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0262553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>