More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4588 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  58.3 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  55.19 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  48.7 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  30.71 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  32.34 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  28.35 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  30.39 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  30.22 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.54 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.28 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.08 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  30.77 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  27 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  26.62 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  29.53 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  29.34 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.87 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  24.36 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.58 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  26.73 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.08 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.6 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  24.66 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 306 aa  62  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.43 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.57 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  38.52 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  25.49 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2462  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2069  extracellular solute-binding protein family 3  29.67 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404874  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  25.78 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  25.98 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  27.74 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.49 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  24.76 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  27.93 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  34.4 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  32.33 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  41.49 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  27.41 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.89 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.41 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.41 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  27.84 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.27 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  26.42 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28 
 
 		 503 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.33 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  28.91 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  29.69 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 503 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  22.61 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.86 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  28.91 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.99 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  25.12 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>