More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1255 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  51.66 
 
 		 277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  45.53 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  34.18 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  37.56 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  32.24 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  27.95 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  32.62 
 
 		 288 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  28.24 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  30.59 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  26.67 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  26.43 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  26.43 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  26.51 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  26.51 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  25.43 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  28.75 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  27.39 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  27.13 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  25.7 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.66 
 
 		 755 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.96 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  27.24 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.34 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  27.16 
 
 		 990 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  29.12 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  25.81 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  27.16 
 
 		 990 aa  72.4  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  25.81 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  27.09 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  27.09 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  27.09 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  27.09 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  27.09 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  27.09 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  25.54 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  27.09 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  27.2 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  27.5 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  25.4 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  27.85 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  27.85 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  27.85 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.03 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  28.24 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  31.21 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  27.4 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  25 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  27.4 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  27.85 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  25.5 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  27.32 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  26.49 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  26.96 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  26.46 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  26.17 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  27.78 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.95 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.95 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1517  ABC transporter extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0341163  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.02 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0925  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.796106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  25.1 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  25.85 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  25 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.38 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>