More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5260 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
277 aa  567  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  89.53 
 
 
277 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  59.14 
 
 
276 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  44.98 
 
 
270 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 
277 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  32.32 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  31.19 
 
 
288 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  28.84 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  26.69 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  27.59 
 
 
280 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  28.76 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  26.46 
 
 
271 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  31.46 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  26.39 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  27.78 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  26.01 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  26.18 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.44 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
258 aa  72  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  29.76 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  25.98 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  26.36 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.36 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  28.14 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.59 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  25.23 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.82 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.91 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.14 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.59 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
503 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
503 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  26.27 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6715  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.39 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  29.59 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.69 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  29.45 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2878  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
246 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 
266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
246 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  24.88 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
245 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
245 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.63 
 
 
264 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  28.27 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  29.23 
 
 
295 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  25.77 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 
266 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  27.4 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  26.92 
 
 
255 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.56 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3247  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  29.06 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.97 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  22.08 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3566  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.28 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  28.63 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
290 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.09 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2325  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.13 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  22.87 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  24.65 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
274 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  27.13 
 
 
281 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4964  extracellular solute-binding protein family 3  29.77 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0641504  normal  0.0820416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>