More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5554 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5554  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5919  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6426  extracellular solute-binding protein  97.96 
 
 
245 aa  487  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5252  extracellular solute-binding protein  78.37 
 
 
255 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.103563  normal  0.182762 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0819  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  70.25 
 
 
253 aa  344  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735222  normal  0.456534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4481  ABC chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  56.33 
 
 
243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  36.82 
 
 
284 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.62 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2325  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  33.2 
 
 
299 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 
281 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3465  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.78 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.955005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4428  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.9 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2326  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.17 
 
 
282 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129152  normal  0.475007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0746  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  28.99 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000227589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.97 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0303  extracellular solute-binding  29.54 
 
 
296 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2962  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
290 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5236  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.64 
 
 
282 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.897169  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0635  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5515  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  27.54 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859546  hitchhiker  0.00100925 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3699  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.07 
 
 
283 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0065  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.58 
 
 
280 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0281  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
281 aa  95.9  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575026  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3171  hypothetical protein  34.19 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2580  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
334 aa  92  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261921 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0666  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 
354 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1745  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00227146  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07260  amino acid-binding protein  25.62 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0877303  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5215  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  22.03 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.30873 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21690  amino acid-binding protein  25.94 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0982947  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29430  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  23.95 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29490  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  26.56 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203368  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4600  extracellular solute-binding protein family 3  23.33 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.100956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
277 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.54 
 
 
755 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.78 
 
 
268 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0076  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717965  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1983  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.100881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  24.79 
 
 
320 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1067  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358006  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1067  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  22.75 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  25.32 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 
305 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5419  extracellular solute-binding protein family 3  30.32 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  22.92 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  30.93 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1345  CjaC  25.33 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000213382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.73 
 
 
267 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5123  extracellular solute-binding protein family 3  29.68 
 
 
275 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.12567 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  21.47 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.34 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5552  ABC transporter substrate binding protein (glutamine)  27.1 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  20.63 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
250 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  20.86 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1009  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.67 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00886439  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1064  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.2 
 
 
289 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00655066  normal  0.28594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.09 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
295 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  25.16 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.18 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 
266 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  33.72 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5150  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
309 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109685  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.29 
 
 
243 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3098  extracellular solute-binding protein family 3  28.86 
 
 
293 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  25.33 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.93 
 
 
243 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.7 
 
 
276 aa  49.3  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4558  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
289 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.776949 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.19 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
260 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  22.4 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  25.12 
 
 
273 aa  48.9  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>