More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4837 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  59.14 
 
 
277 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  62.55 
 
 
277 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  57.53 
 
 
270 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  55.19 
 
 
275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 
282 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  31.84 
 
 
273 aa  99  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
277 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  31.89 
 
 
280 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  34.15 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  27.8 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.57 
 
 
267 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0407  putative ABC transporter binding protein subunit  32.98 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.65 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04090  putative binding protein component of ABC transporter  32.98 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2113  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  31.93 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  32.04 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.93 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.93 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.65 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.24 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  28.5 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.33 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.03 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.93 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.34 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  31.68 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.93 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  39.34 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.93 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.93 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  30.48 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.5 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  28.95 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  31.16 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  44.57 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.28 
 
 
264 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  25.12 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
266 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.96 
 
 
260 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0591  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  28.57 
 
 
269 aa  62.4  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0748117  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1594  arginine-binding protein  28.57 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
503 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  31.84 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  24.71 
 
 
251 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  29.31 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  26.82 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  24.43 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0443  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  32.04 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  24.55 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  24.55 
 
 
270 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.69 
 
 
503 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2763  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  29.19 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1531  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0450484  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1432  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.81 
 
 
260 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.897061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>