165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0285 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 266 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  39.52 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  31.9 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  32.03 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  29.92 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.78 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  30.47 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  26.21 
 
 		 207 aa  99.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  29.25 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  25.48 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  25.56 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  30.26 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  26.5 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  25.19 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  26.11 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  31.09 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  24.18 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  24.18 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  28.57 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.6 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  24.6 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  24.6 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  23.77 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.6 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.6 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  24.6 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.63 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.79 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.19 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.19 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.4 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  20.5 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  26.84 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  21.45 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.2 
 
 		 485 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.2 
 
 		 485 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  25 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  23.74 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.05 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.31 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  26.92 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.01 
 
 		 288 aa  52.8  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  21.54 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  20.76 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  24.07 
 
 		 340 aa  52  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  24.31 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.24 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  23.94 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  24.31 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  24.08 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  23.35 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  26.57 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  23.96 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  28.08 
 
 		 261 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.16 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  25.89 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  26.42 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.35 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>