150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1297 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 248 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  35.27 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  31.09 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  30.86 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  27.81 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  25.4 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.57 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  29.78 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  27.41 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.33 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.36 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  27.12 
 
 		 273 aa  65.1  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  24.12 
 
 		 286 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  28.92 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  23.33 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.74 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.67 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.23 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  26.07 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.15 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  21.15 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.65 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.21 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.15 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  21.15 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  25.2 
 
 		 261 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.15 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.15 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  21.65 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  29.56 
 
 		 990 aa  52  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  29.56 
 
 		 990 aa  52  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  25.2 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  25.2 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  25.2 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  25.2 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.5 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  25.2 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  25.2 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 294 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  25.21 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.77 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  25.99 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.36 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.63 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.5 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.5 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.5 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.5 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.1 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.88 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  25.22 
 
 		 274 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  23.41 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.6 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.47 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.47 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  24.19 
 
 		 277 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  30.2 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.36 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.36 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.36 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  24.76 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  22.22 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>