104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7267 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  94.21 
 
 		 244 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  94.17 
 
 		 349 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  92.98 
 
 		 244 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  92.56 
 
 		 244 aa  434  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  91.8 
 
 		 244 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  82.79 
 
 		 244 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  76.25 
 
 		 243 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  76.25 
 
 		 243 aa  358  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  75.42 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  70.46 
 
 		 250 aa  334  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  69.42 
 
 		 273 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  68.03 
 
 		 245 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  65.83 
 
 		 277 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  66.8 
 
 		 247 aa  311  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  65.27 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  62.5 
 
 		 249 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  48.57 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  52.68 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  49.27 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  46.46 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  38.71 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  38.33 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.04 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  28.83 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.83 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.72 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  28.48 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  27.98 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  23.38 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  23.38 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  28.05 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  21.03 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  25.44 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  24.53 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  25.24 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  23.56 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.94 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 324 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 		 308 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  27.36 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.98 
 
 		 751 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  25.29 
 
 		 270 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  22.8 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  33.02 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  23.76 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  25.21 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.83 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  23.01 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  25.93 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  24.2 
 
 		 990 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  24.2 
 
 		 990 aa  43.5  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  25.95 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5765  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000625971 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  25.97 
 
 		 261 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  28.45 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2403  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2449  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2443  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 222 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  21.54 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 277 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2410  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.709389 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>