90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6880 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  85.25 
 
 		 244 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  82.79 
 
 		 264 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  84.3 
 
 		 244 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  82.64 
 
 		 244 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  83.06 
 
 		 244 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  82.92 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  75.41 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  75.41 
 
 		 243 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  74.59 
 
 		 243 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  71.31 
 
 		 250 aa  335  3.9999999999999995e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  71.49 
 
 		 273 aa  332  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  66.8 
 
 		 245 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  65.57 
 
 		 247 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  64.41 
 
 		 277 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  65.25 
 
 		 248 aa  292  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  64.14 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  47.93 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  48.78 
 
 		 207 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  49.78 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  50 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  46.88 
 
 		 238 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  42.13 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  37.92 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  29.52 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.36 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  27.15 
 
 		 277 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 282 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 265 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.38 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  26.38 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  26.76 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  26.76 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 256 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 260 aa  48.5  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2102  histidine kinase  31.5 
 
 		 575 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  26.51 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  32.22 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 		 279 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  25.98 
 
 		 751 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 276 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  25.58 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 		 1165 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  28.48 
 
 		 283 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 		 615 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  27.12 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  25.55 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3278  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.82 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  25.64 
 
 		 254 aa  42.7  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3689  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 935 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2912  glutamine ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.19 
 
 		 277 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  25.85 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1774  histidine kinase  29.13 
 
 		 578 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2410  extracellular solute-binding protein  34.31 
 
 		 286 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 295 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.87 
 
 		 260 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 256 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  34.52 
 
 		 257 aa  42  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  32.95 
 
 		 266 aa  42  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>