More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0736 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 279 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  85.31 
 
 		 306 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  49.58 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  44.19 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  28.44 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  31.56 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  31.2 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  30.04 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  32 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  32 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  32 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  32 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  32 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  32 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  32 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  31.11 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  25.88 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  27.27 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  32.87 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  32.88 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  32.88 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  32.88 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  31.36 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  32.24 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  28.06 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  27.67 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  31.69 
 
 		 268 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.82 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  31.82 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  31.25 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.64 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  31.25 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.44 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  23.21 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  32.19 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  31.56 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.71 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  26.67 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  24.21 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  22.71 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  31.25 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  28.02 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  23.83 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  26.99 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.15 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  27.8 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.15 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  26.15 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.57 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  28.95 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.48 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  28.75 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.48 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  27.45 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  23.29 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  31.19 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  29.95 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.35 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  27.66 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.89 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  27.66 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  25.44 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.38 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.49 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.43 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.21 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.21 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.21 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  27.84 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  25.76 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  23.97 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  24.06 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.4 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.4 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.4 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.4 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  24.44 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  24.44 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  26.89 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  26.1 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  27.98 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>