More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1440 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 273 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  97.2 
 
 		 250 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  77.87 
 
 		 253 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2392  extracellular solute-binding protein family 3  61.63 
 
 		 255 aa  328  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  60.16 
 
 		 276 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3587  extracellular solute-binding protein  61.06 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0232  extracellular solute-binding protein  53.72 
 
 		 248 aa  276  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  53.04 
 
 		 250 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  51.13 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1500  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.46 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238692  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2745  extracellular solute-binding protein family 3  47.6 
 
 		 254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2369  extracellular solute-binding protein  49.36 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5575  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6014  extracellular solute-binding protein  47.53 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4027  extracellular solute-binding protein  47.53 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4339  extracellular solute-binding protein  47.53 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0776  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.11 
 
 		 270 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0854  extracellular solute-binding protein family 3  36.64 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0178983  normal  0.218059 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.22 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  32.58 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  35.14 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  35.14 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  34.54 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.58 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 		 247 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  33.75 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.47 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.46 
 
 		 265 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  35.8 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.08 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  33.62 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  32.59 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  32.41 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  34.68 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.48 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 277 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  32.14 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  31.7 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.7 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  32.88 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.23 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  28.08 
 
 		 502 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.33 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.33 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  31.98 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.44 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.33 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  28.08 
 
 		 502 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  32.76 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.92 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  31.25 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.53 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.56 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  31.53 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  31.53 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.92 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.77 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>