More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1335 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  90.77 
 
 		 263 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  76.61 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  74.09 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  71.37 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  73.5 
 
 		 255 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  56.57 
 
 		 265 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  56.57 
 
 		 260 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  56.22 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  55.98 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  50.58 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  55.95 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  55.95 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  55.95 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  55.95 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  55.95 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  55.95 
 
 		 261 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  58.37 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  58.37 
 
 		 270 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  58.37 
 
 		 270 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  55.82 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  57.94 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  55.56 
 
 		 261 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  57.76 
 
 		 266 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  55.74 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  56.22 
 
 		 270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  49.59 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  49.2 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  49.38 
 
 		 271 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  47.69 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  50 
 
 		 268 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  48.8 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  48.7 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  43.88 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  45.09 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  41.18 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  39.11 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  32.5 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  32.34 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.91 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.49 
 
 		 254 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.51 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  32.13 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  32.13 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  27.97 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  23.41 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  26.03 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  28.99 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.43 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  23.02 
 
 		 266 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  25.41 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  23.51 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  22.49 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  24.08 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.43 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.6 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  29.95 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  23.69 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29.47 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29.47 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29.47 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  26.2 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.23 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.57 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  26.57 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.76 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.57 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  26.91 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  25.84 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.21 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.43 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  24.68 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28.71 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  25.23 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.83 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  23.87 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>