More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4388 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 246 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  87.28 
 
 		 256 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  50.22 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  50 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  50.64 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  50.21 
 
 		 270 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  49.38 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  48.05 
 
 		 268 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  50 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  46.75 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  50.46 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  49.53 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  50 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  50 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  49.54 
 
 		 258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  49.53 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  49.53 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  49.53 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  49.53 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  49.53 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  49.53 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  48.6 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  49.54 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  49.54 
 
 		 270 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  49.07 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  46.26 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  44.63 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  43.88 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  44.54 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  44.59 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  42.86 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  43.9 
 
 		 284 aa  191  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  40.52 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  42.45 
 
 		 421 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  41.2 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  39.41 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  41.67 
 
 		 266 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  36.29 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.86 
 
 		 256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.86 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  37.85 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.83 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.97 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.63 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.63 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.63 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.43 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.17 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  29.67 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.86 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.86 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.86 
 
 		 266 aa  95.5  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.03 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 278 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.15 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.67 
 
 		 278 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.39 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  30.28 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.23 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.23 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.23 
 
 		 266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  33.53 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  32.94 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.94 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 266 aa  92  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.94 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.94 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.94 
 
 		 266 aa  91.7  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 273 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.94 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.94 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  32.53 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  26.42 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.94 
 
 		 266 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.12 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.81 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.16 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.81 
 
 		 265 aa  89.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 273 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 266 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  31 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 271 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  28.12 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.12 
 
 		 320 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  28.12 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>