More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2470 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  100 
 
 
260 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 
253 aa  185  8e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  39.29 
 
 
268 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  41.2 
 
 
268 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  43.54 
 
 
263 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  36.68 
 
 
260 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  37.5 
 
 
267 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  37.8 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  37.19 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  37.77 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  36.48 
 
 
266 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  36.29 
 
 
270 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  37.45 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  37.45 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  37.45 
 
 
270 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  37.77 
 
 
265 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  36.02 
 
 
264 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  37.39 
 
 
265 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  37.02 
 
 
270 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  37.66 
 
 
255 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  37.08 
 
 
271 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  36.67 
 
 
270 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  35.04 
 
 
284 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  33.85 
 
 
273 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  39.66 
 
 
256 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  34.88 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  34.88 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  34.88 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  34.88 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  34.88 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  34.88 
 
 
261 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  36.91 
 
 
258 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  34.5 
 
 
261 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  34.26 
 
 
263 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  32.69 
 
 
263 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.45 
 
 
256 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  37.87 
 
 
421 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  36.93 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  38.8 
 
 
246 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.82 
 
 
256 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  35.82 
 
 
254 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.82 
 
 
254 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  34.19 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  31.62 
 
 
258 aa  119  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  33.47 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  34.54 
 
 
266 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 
264 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.95 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.64 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.08 
 
 
264 aa  89  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  26.29 
 
 
272 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.5 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
272 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  26.14 
 
 
266 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.69 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  25.43 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.41 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  25.86 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
270 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.1 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.1 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.41 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.1 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  25.97 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  27.84 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  25.97 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  25.97 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  27.09 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  25.64 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  25.4 
 
 
268 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  25.76 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
264 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.2 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.58 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.73 
 
 
503 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.18 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.18 
 
 
264 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  26.7 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.18 
 
 
264 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>