More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4447 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  73.62 
 
 		 255 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  75.49 
 
 		 255 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  71.89 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  71.77 
 
 		 263 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  70.28 
 
 		 263 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  57.47 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  57.37 
 
 		 265 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  56.92 
 
 		 260 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  58.65 
 
 		 265 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  58.27 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  58.27 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  58.27 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  58.27 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  58.27 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  58.27 
 
 		 261 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  57.87 
 
 		 261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  60.78 
 
 		 266 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  60.78 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  59.91 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  59.91 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  59.91 
 
 		 270 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  58.72 
 
 		 270 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  59.05 
 
 		 270 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  52.5 
 
 		 273 aa  288  9e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  53.02 
 
 		 266 aa  281  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  44.88 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  47.46 
 
 		 268 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  47.83 
 
 		 263 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  47.7 
 
 		 271 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  47.28 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  45.6 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  45.22 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3744  chorismate mutase, putative  42.24 
 
 		 421 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  39.67 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  38.74 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  39.91 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  37.71 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  37.66 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  40.27 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.24 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  36.82 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  32.79 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  32.94 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0714  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  33.05 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0236853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  25.81 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  25.4 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  24.48 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  26.05 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  25.96 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  24.47 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.7 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  23.89 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  26.15 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.53 
 
 		 278 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  22.18 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 306 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  24.71 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  21.37 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  25.76 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  21.25 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  21.19 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  25.1 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0683  extracellular solute-binding protein  38.2 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.732102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  26.13 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.07 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2775  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.84 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.550613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  24.56 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.92 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  26.62 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.94 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.59 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.62 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  33.66 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>