More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3950 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  57.51 
 
 
264 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  57.83 
 
 
261 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
260 aa  141  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.73 
 
 
257 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  36.1 
 
 
275 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
260 aa  125  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.8 
 
 
264 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.96 
 
 
260 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.88 
 
 
266 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.84 
 
 
264 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  32.3 
 
 
264 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
266 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 
260 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
264 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 
270 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.58 
 
 
267 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
264 aa  122  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.64 
 
 
264 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
264 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.61 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0974  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2802  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.602775  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.96 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.96 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.96 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.96 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.96 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.96 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.96 
 
 
284 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.93 
 
 
265 aa  118  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.74 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
261 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
285 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  29.96 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  32.92 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.07 
 
 
266 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.07 
 
 
266 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.07 
 
 
266 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5122  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123771  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  32.55 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  30.2 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.34 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.27 
 
 
273 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
283 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
266 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.15 
 
 
266 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  29.02 
 
 
266 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 
266 aa  113  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0657  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.37 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.35 
 
 
266 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.18 
 
 
260 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
253 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  28.89 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
257 aa  111  9e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.41 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.12 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  28.51 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0691  extracellular solute-binding protein  29.37 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0235172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  28.51 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.95 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.95 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
246 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.73 
 
 
266 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  30.67 
 
 
266 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
248 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.35 
 
 
276 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.73 
 
 
266 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
276 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.73 
 
 
266 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
260 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  33.05 
 
 
259 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
260 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  29.92 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>