More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1872 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  85.31 
 
 		 279 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  49.58 
 
 		 256 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  45.49 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  29.74 
 
 		 271 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  29.31 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  30.91 
 
 		 270 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  29.06 
 
 		 267 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  25.66 
 
 		 272 aa  96.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2945  prephenate dehydratase  29.49 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0273907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  24.12 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0110  prephenate dehydratase  29.49 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  32.76 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0125  arogenate dehydratase  29.49 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  29.82 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  28.7 
 
 		 264 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 		 261 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  29.15 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 268 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  30.56 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  26.24 
 
 		 258 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  26.56 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  30.18 
 
 		 258 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  32.33 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  26.24 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  23.11 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0738  Prephenate dehydratase  28.99 
 
 		 255 aa  88.2  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  26.67 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  31.07 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  30.65 
 
 		 266 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  28.87 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  29.65 
 
 		 265 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.7 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.7 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.7 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  26.55 
 
 		 256 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  26.32 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.32 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4447  arogenate dehydratase  29.33 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.393788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  26.89 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  23.11 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.81 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3024  arogenate dehydratase  29.65 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  24.79 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.34 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  26.18 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.7 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.86 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  26.1 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.71 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.48 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.48 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  27.66 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  26.81 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  28.5 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1335  cyclohexadienyl dehydratase, putative  26.23 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  20.7 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  24.5 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  24.1 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  24.5 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  24.5 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  24.5 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  27.46 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  23.53 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  26.38 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  24.5 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  24.66 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  25.73 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  28.09 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7508  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  23.83 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  26.09 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  29.25 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  26.07 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.73 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.91 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  22.03 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>