More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1846 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 277 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3278  extracellular solute-binding protein  85.38 
 
 		 276 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0513  extracellular solute-binding protein family 3  44.06 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3183  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.76 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 		 246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  33.79 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  32.88 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  27.53 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.99 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.44 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.97 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.5 
 
 		 502 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.5 
 
 		 502 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  30.35 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  29.18 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.93 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  29.01 
 
 		 265 aa  99.4  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.57 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.08 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.52 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.91 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.17 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28.76 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.54 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.75 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.17 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.08 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.48 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 		 285 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.52 
 
 		 285 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.17 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.75 
 
 		 264 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.67 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.13 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.91 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 268 aa  95.5  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  28.05 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 283 aa  94  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  31.62 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.33 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28.95 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28.95 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28.95 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  28.51 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  31.7 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  28.14 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  28.14 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.53 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  27.19 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  26.82 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  28.28 
 
 		 265 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 244 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 260 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 253 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.74 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.63 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.63 
 
 		 513 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  26.84 
 
 		 244 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.95 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.34 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  27.93 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 260 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>