More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3278 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3278  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 276 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  83.39 
 
 		 277 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0513  extracellular solute-binding protein family 3  42.75 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3183  extracellular solute-binding protein  34.81 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  36.89 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  31.88 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.3 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  31.96 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  31.96 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  31.96 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.96 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  31.86 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  32.81 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  29.37 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.92 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.67 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  27.9 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  29.55 
 
 		 265 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  29.86 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  25.51 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.13 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.09 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.36 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.36 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.36 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.69 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.97 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  27.55 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 249 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 		 269 aa  93.2  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.01 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  32.31 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.01 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.86 
 
 		 248 aa  92  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  27.52 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  25.89 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  25.89 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  28.76 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  25.89 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.89 
 
 		 264 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.8 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.79 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.46 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.17 
 
 		 252 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.34 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.79 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 283 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  26.52 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  26.52 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  28.64 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  25 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  26.72 
 
 		 502 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  26.72 
 
 		 502 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  30.37 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.88 
 
 		 244 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.91 
 
 		 248 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 246 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  28.45 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  27.51 
 
 		 264 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.51 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 266 aa  89  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.51 
 
 		 266 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.09 
 
 		 244 aa  89  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 286 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.98 
 
 		 285 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  28.44 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  26.59 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.84 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.95 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  31.6 
 
 		 501 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>