76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6466 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  98.36 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  98.36 
 
 		 244 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  92.56 
 
 		 264 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  89.67 
 
 		 244 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  88.84 
 
 		 244 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  83.06 
 
 		 244 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  75.73 
 
 		 243 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  75.73 
 
 		 243 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  74.9 
 
 		 243 aa  346  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  70.04 
 
 		 250 aa  329  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  68.44 
 
 		 273 aa  320  9.000000000000001e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  66.24 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  65.84 
 
 		 245 aa  307  8e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  64.46 
 
 		 247 aa  295  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  64.02 
 
 		 248 aa  288  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  61.41 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  48.55 
 
 		 269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  50.45 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  46.83 
 
 		 207 aa  198  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  50.43 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  44.69 
 
 		 238 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  41.4 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  37.92 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.94 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.61 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.61 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  28.99 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  20.72 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 275 aa  48.9  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  28.21 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.84 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  31.34 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  25.65 
 
 		 326 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  26.5 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 		 276 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 267 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 276 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  24.07 
 
 		 290 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 260 aa  45.4  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 324 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  31.25 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  24.26 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  24.26 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  26.16 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  26.39 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 308 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.48 
 
 		 494 aa  42  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>