162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45195 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.33 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  37.34 
 
 		 245 aa  135  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  37.92 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  37.92 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 349 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  37.23 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  35.15 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  37.56 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.43 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  28.36 
 
 		 207 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  32.79 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  25.43 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  27.75 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.24 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  26.85 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  24.06 
 
 		 286 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  23.53 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  26.17 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  25.5 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  25.5 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 		 1251 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  25.31 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  22.49 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  22.62 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  24 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0729  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446742  normal  0.30254 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.83 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  27.31 
 
 		 268 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.79 
 
 		 273 aa  47  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  22.13 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  26.17 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  25.68 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  29.63 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.55 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  25.68 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  24.08 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1098  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.041078  normal  0.0345837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 251 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.23 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  23.59 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  24.87 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 589 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.09 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  27.52 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  24.87 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  23.59 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  24.87 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  24.87 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  23.59 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  24.87 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.53 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0887  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.06 
 
 		 281 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  24.87 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>