138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2836 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  65.71 
 
 		 247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  65.85 
 
 		 264 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  67.78 
 
 		 243 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  68.2 
 
 		 243 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  68.2 
 
 		 243 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  65.98 
 
 		 273 aa  300  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  65.98 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  65.84 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  66.26 
 
 		 244 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  65.31 
 
 		 244 aa  294  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  65.56 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  64.9 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  63.98 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  62.4 
 
 		 245 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  58.94 
 
 		 249 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  61.6 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  45.04 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  46.08 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  51.71 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  47.37 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  38.63 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  38.92 
 
 		 237 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.26 
 
 		 223 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  28.05 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.67 
 
 		 278 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  28.12 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  37 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  37.62 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.99 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  30.67 
 
 		 276 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.27 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  30.06 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 274 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1094  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382529  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  32.26 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.27 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.27 
 
 		 286 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  35.24 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  27.97 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1705  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3305  cyclohexadienyl dehydratase  25.88 
 
 		 264 aa  48.5  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  30.99 
 
 		 275 aa  48.5  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  29.71 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  25.55 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1907  histidine kinase  28.91 
 
 		 560 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.649995 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0111  prephenate dehydratase  24.03 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.669855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  26.79 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  24.68 
 
 		 261 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 		 252 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  24.56 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13990  putative amino acid ABC transporter  24.84 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258104  normal  0.0183711 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  24.68 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 		 505 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  24.68 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  24.68 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  24.68 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  24.68 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  24.68 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  29.55 
 
 		 457 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  24.71 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  27.92 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  28.99 
 
 		 244 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.42 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1240  amino acid binding protein  24.84 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3978  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  26.72 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  23.53 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2743  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0284405  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3211  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3291  cyclohexadienyl dehydratase  23.38 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.87694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0782  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 270 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2449  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2443  extracellular solute-binding protein  33.85 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.552006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>