More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1034 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1034  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 505 aa  1022    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.121119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0524  periplasmic binding transport protein/transglycosylase  41.2 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.60685  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4438  lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 516 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.662285  normal  0.867031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1506  Lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 		 485 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0243609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2520  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004396  transglycosylase Slt family  38.05 
 
 		 502 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0787  putative transglycosylase protein  34.83 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1492  lytic transglycosylase, catalytic  34.99 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.928362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01003  hypothetical protein  36.59 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6050  lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 505 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656585  hitchhiker  0.00000979429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01772  hypothetical protein  34.72 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2659  lytic transglycosylase, catalytic  34.51 
 
 		 508 aa  264  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2552  transglycosylase SLT domain/extracellular solute-binding domain-containing protein  38.05 
 
 		 517 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0335  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 499 aa  256  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0786  transglycosylase protein  34.99 
 
 		 433 aa  246  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27050  Slt family transglycosylase  35.65 
 
 		 476 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2289  putative glycosylase  35.57 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2442  lytic transglycosylase, catalytic  32.62 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.207678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23020  Lytic transglycosylase protein  32.31 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2061  SLT  30.93 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1914  lytic transglycosylase catalytic  32.15 
 
 		 468 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260626  hitchhiker  0.00000000157074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1754  lytic transglycosylase catalytic  32.42 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2256  transglycosylase, SLT family  30.52 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.52446  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4020  lytic transglycosylase, catalytic  30.97 
 
 		 473 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2312  lytic transglycosylase family protein  32.01 
 
 		 468 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000348067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3457  lytic transglycosylase, catalytic  32.01 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.593202  hitchhiker  0.000121257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0497  putative transglycosylase  31.03 
 
 		 457 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2596  putative transglycosylase  31.18 
 
 		 456 aa  156  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3239  Slt family transglycosylase  30.2 
 
 		 714 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1033  putative transglycosylase  30.7 
 
 		 485 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336568  normal  0.533813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1036  putative transglycosylase  30.23 
 
 		 449 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1077  putative transglycosylase  30.47 
 
 		 485 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0564532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4190  putative transglycosylase  31.15 
 
 		 485 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0675173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1646  lytic transglycosylase, catalytic  31.38 
 
 		 528 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1004  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0784761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0998  putative transglycosylase  28.57 
 
 		 486 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1005  putative transglycosylase  33.56 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15720  putative transglycosylase  28.82 
 
 		 451 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000412492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1268  putative transglycosylase  28.35 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3415  putative transglycosylase  29.16 
 
 		 488 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1327  Lytic transglycosylase catalytic  29.23 
 
 		 511 aa  136  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.566975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1458  periplasmic binding domain/transglycosylase SLT domain fusion protein  28.91 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39670  putative transglycosylase  29.75 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1477  putative transglycosylase  28.96 
 
 		 501 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2311  putative transglycosylase  27.35 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.736491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1018  putative transglycosylase  29 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0598275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1049  putative transglycosylase  29.48 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00903015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1353  putative transglycosylase  28.79 
 
 		 490 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3674  putative transglycosylase  27.33 
 
 		 518 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1131  putative transglycosylase  28.37 
 
 		 472 aa  124  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00229364  normal  0.195438 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1316  putative transglycosylase  28.33 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237496  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1237  putative transglycosylase  28.72 
 
 		 478 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1239  putative transglycosylase  28.72 
 
 		 478 aa  117  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1300  putative transglycosylase  27 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3120  putative transglycosylase  28.4 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1308  putative transglycosylase  28.46 
 
 		 478 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3288  putative transglycosylase  27.08 
 
 		 457 aa  113  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1140  putative transglycosylase  26.38 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2995  putative transglycosylase  28.31 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.049065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2643  putative transglycosylase  27.08 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2981  putative transglycosylase  28.31 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3114  lytic transglycosylase, catalytic  28.34 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3139  putative transglycosylase  28.31 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1382  putative transglycosylase  28.31 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.249867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1563  putative transglycosylase  29.14 
 
 		 480 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.158828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2485  lytic transglycosylase, catalytic  28.41 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0392  putative transglycosylase  27.25 
 
 		 530 aa  106  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0749  putative transglycosylase  25.45 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01149  putative transglycosylase  26.2 
 
 		 534 aa  103  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1081  putative transglycosylase  26.46 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1272  putative transglycosylase  26.09 
 
 		 494 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0840  lytic transglycosylase  26.76 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2772  putative transglycosylase  27.32 
 
 		 486 aa  100  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2351  putative transglycosylase  27.48 
 
 		 502 aa  99.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115829  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004281  transglycosylase Slt family  25.88 
 
 		 525 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1582  lytic transglycosylase, catalytic  30.05 
 
 		 410 aa  97.8  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208694 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1146  putative transglycosylase  25.49 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1252  putative transglycosylase  25.49 
 
 		 513 aa  97.8  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.831517  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3622  putative transglycosylase  25.49 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1046  lytic transglycosylase, catalytic  29.4 
 
 		 450 aa  97.1  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.872  normal  0.0396105 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1004  putative transglycosylase  26.59 
 
 		 462 aa  96.7  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00893953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01395  transglycosylase, SLT family protein  26.85 
 
 		 437 aa  95.9  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1230  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3794  putative transglycosylase  26.17 
 
 		 518 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1110  Lytic transglycosylase catalytic  26.17 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2711  putative transglycosylase  26.17 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2729  putative transglycosylase  25.22 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2924  putative transglycosylase  26.17 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2833  putative transglycosylase  25.22 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.459911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1119  putative transglycosylase  26.17 
 
 		 518 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2770  putative transglycosylase  25.22 
 
 		 514 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2945  putative transglycosylase  25 
 
 		 514 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0975  lytic transglycosylase catalytic  25.56 
 
 		 482 aa  90.5  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2712  putative transglycosylase  26.17 
 
 		 518 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3655  putative transglycosylase  25.89 
 
 		 493 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0695  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 523 aa  87.4  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.114922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3053  putative transglycosylase  24.4 
 
 		 508 aa  87  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1301  lytic transglycosylase, catalytic  25.71 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.462957  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1757  lytic transglycosylase, catalytic  24.38 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1113  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0126627  normal  0.0207439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>