45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3455 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 279 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 264 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  38.42 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  33.99 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  31.43 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  30.7 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  31.39 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.03 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  32.42 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 		 349 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  30.41 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  29.49 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 244 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  29.95 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  28.11 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  25.71 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0231  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.9 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0235  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2113  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 		 764 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4924  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 261 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263703 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 278 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3698  extracellular solute-binding protein family 3  25.15 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7224  ABC transporter substrate binding protein (nopaline)  26.38 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3855  extracellular solute-binding protein family 3  26.52 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.868062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4163  extracellular solute-binding protein family 3  25.9 
 
 		 257 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  20.18 
 
 		 275 aa  42  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3835  extracellular solute-binding protein family 3  25.31 
 
 		 257 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>