More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4039 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0395  extracellular solute-binding protein  66.14 
 
 		 267 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  63.27 
 
 		 269 aa  337  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4217  ABC type amino acid transport system periplasmic component protein  64.58 
 
 		 265 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  64.98 
 
 		 265 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  64.41 
 
 		 265 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0463  extracellular solute-binding protein  59.45 
 
 		 263 aa  295  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0910  extracellular solute-binding protein  58.65 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2760  extracellular solute-binding protein  44.16 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.19 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2763  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  30.92 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  31.13 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  30.21 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.28 
 
 		 503 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.53 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.88 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  30.73 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.89 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  34.19 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.51 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.7 
 
 		 503 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.95 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.8 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.34 
 
 		 251 aa  96.3  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4637  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 275 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  30.38 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  29.41 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  25.86 
 
 		 489 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  26.85 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1925  solute-binding family 1 protein  29.44 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  28.15 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.86 
 
 		 489 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.39 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.62 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.62 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  25.86 
 
 		 489 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.89 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  30.13 
 
 		 502 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.87 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  27.06 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.3 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  30.13 
 
 		 502 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.27 
 
 		 513 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2062  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.14 
 
 		 499 aa  92.8  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 243 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.34 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  27.84 
 
 		 250 aa  92.4  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 283 aa  92.4  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 		 285 aa  92  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.84 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.92 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  27.92 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.2 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  26.84 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.92 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  29.82 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1132  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  24.89 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>