More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0395 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0395  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 267 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  66.14 
 
 		 262 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  60.83 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4217  ABC type amino acid transport system periplasmic component protein  55.6 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  58.23 
 
 		 265 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  58.05 
 
 		 265 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0463  extracellular solute-binding protein  57.48 
 
 		 263 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0910  extracellular solute-binding protein  56.36 
 
 		 266 aa  271  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2760  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2763  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.18 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.9 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  28.9 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  31.27 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.56 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.84 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.03 
 
 		 503 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  30.87 
 
 		 241 aa  98.6  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.9 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.11 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  28.83 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 244 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1232  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.77 
 
 		 503 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0615942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.81 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  26.14 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  24.78 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  30.45 
 
 		 255 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.73 
 
 		 489 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  28.64 
 
 		 489 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2062  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.73 
 
 		 499 aa  91.3  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.64 
 
 		 489 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.85 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  27.51 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  25.76 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 285 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.39 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.39 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  25.74 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  27.23 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  27.31 
 
 		 251 aa  89  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  28.07 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  24.07 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2439  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.732764  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2487  extracellular solute-binding protein  22.52 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  25.93 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  23.48 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.96 
 
 		 243 aa  87  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 247 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.16 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  28.18 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 222 aa  85.9  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 250 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.58 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  26.22 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.85 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  27.5 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>