More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0910 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0910  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
266 aa  529  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31827  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4217  ABC type amino acid transport system periplasmic component protein  61.54 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  61.41 
 
 
265 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  61.51 
 
 
269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  61.92 
 
 
265 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0463  extracellular solute-binding protein  60.67 
 
 
263 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  58.9 
 
 
262 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0395  extracellular solute-binding protein  56.2 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2760  extracellular solute-binding protein  44.21 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  29.82 
 
 
255 aa  108  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  30.27 
 
 
242 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  27.63 
 
 
246 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 
260 aa  106  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.82 
 
 
265 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.82 
 
 
265 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.82 
 
 
265 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.82 
 
 
265 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.39 
 
 
265 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.39 
 
 
265 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  29.39 
 
 
265 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.39 
 
 
265 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  29.54 
 
 
273 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2763  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
248 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.95 
 
 
265 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
265 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
254 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
281 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.43 
 
 
260 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
265 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  28.35 
 
 
246 aa  101  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.95 
 
 
256 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
252 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.31 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.63 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.63 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 
264 aa  99  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
277 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  27.71 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.71 
 
 
263 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  26.44 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.88 
 
 
248 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
283 aa  92  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.29 
 
 
248 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.67 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.88 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.88 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.88 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  27.16 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.88 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.32 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  27.27 
 
 
241 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.17 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.38 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
285 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  28.33 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  23.21 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  27.35 
 
 
266 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  28.93 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.63 
 
 
271 aa  89  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 
284 aa  89  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
247 aa  89  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  26.27 
 
 
248 aa  89  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.07 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.62 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2016  extracellular solute-binding protein  29 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.504663  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0869  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0372  ABC basic amino acid transporter, solute-binding protein  29 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.85 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  27.4 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.02 
 
 
264 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.85 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  26.84 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28.74 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.14 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.9 
 
 
247 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.55 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  28.57 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  28.44 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>