More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6259 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  58.3 
 
 		 275 aa  315  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  57.53 
 
 		 276 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  44.98 
 
 		 277 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  49.38 
 
 		 277 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3969  extracellular solute-binding protein family 3  29.34 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  32.34 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  32.99 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.63 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 		 485 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 		 485 aa  79  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3866  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.3 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2153  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.878333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.78 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  31.33 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  27.62 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  25.39 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  27.62 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  30.85 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  29.35 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  27.32 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4374  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  30.1 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0741  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  27.76 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  28.8 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  26.6 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  28.37 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0724  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0821  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0206084  normal  0.0792038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0366  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.996881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0849  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0453147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.17 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  28.72 
 
 		 485 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0043  cyclohexadienyl dehydratase  27.87 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.561569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  26.73 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.47 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.47 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.47 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0941  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  22.6 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4545  extracellular solute-binding protein family 3  28.94 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.486502  normal  0.0898328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3279  polar amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.6 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1651  cyclohexadienyl dehydratase precursor  24.89 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3412  arogenate dehydratase  22.6 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40472  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9241  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  26.29 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  26.21 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3939  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.16 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  hitchhiker  0.00393875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.08 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6374  extracellular solute-binding protein family 3  28.94 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213399  normal  0.625492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2538  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527572  normal  0.516137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  26 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  33.11 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4428  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.71 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_003296  RS05402  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  28.92 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2878  extracellular solute-binding protein family 3  34.03 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3432  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0736  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.580874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2470  cyclohexadienyl dehydratase  25.7 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00435864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  26 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0286  prephenate dehydratase  23.39 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.61 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.76 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 266 aa  62  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.83 
 
 		 503 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.09 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  24.81 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>