204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3566 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3566  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2878  extracellular solute-binding protein family 3  83.91 
 
 		 284 aa  464  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2877  extracellular solute-binding protein family 3  57.87 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5081  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4214  cyclohexadienyl dehydratase  29.95 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.14 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  28.87 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.82 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002034  cyclohexadienyl dehydratase  28.17 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  26.37 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  27.54 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00417  prephrenate dehydratase  26.27 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  25.54 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5260  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4388  extracellular solute-binding protein family 3  26.5 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2103  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.27 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2961  cyclohexadienyl dehydratase  29.08 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3350  cyclohexadienyl dehydratase  29.08 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1581  cyclohexadienyl dehydratase  29.08 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3233  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.638648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3021  cyclohexadienyl dehydratase  29.08 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1255  hypothetical protein  28.49 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0172  cyclohexadienyl dehydratase  29.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  27.96 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3964  cyclohexadienyl dehydratase  29.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4037  cyclohexadienyl dehydratase  29.08 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2375  Arogenate dehydratase  25.38 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  26.86 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6259  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 		 270 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000314466  normal  0.29457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  25.57 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5243  extracellular solute-binding protein family 3  28.14 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.75 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1151  prephenate dehydratase  28.64 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2779  Arogenate dehydratase  24.47 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4767  Prephenate dehydratase  29.19 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.678819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4837  extracellular solute-binding protein family 3  30.57 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630065  normal  0.0224847 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0017  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3814  cyclohexadienyl dehydratase  25.51 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.607683  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0706  Prephenate dehydratase  24.72 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2737  arogenate dehydratase  28.74 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47143  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0230  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 268 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  34.15 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1745  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00227146  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3463  extracellular solute-binding protein family 3  35.79 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  25.52 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  33.33 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  26.04 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0211  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.68 
 
 		 503 aa  50.8  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  25.89 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5520  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222381  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.99 
 
 		 273 aa  50.4  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 268 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0109  arogenate dehydratase  27.01 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 279 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  28.1 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 294 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3313  extracellular solute-binding protein family 3  33.03 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.62 
 
 		 271 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 		 267 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.73 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  26.97 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3469  extracellular solute-binding protein family 3  33.03 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5457  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  35.14 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0614  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.75 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1498  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3515  extracellular solute-binding protein family 3  28.69 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.821579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  27.01 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  26.88 
 
 		 500 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  28.4 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6331  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483344  normal  0.916228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1534  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6996  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0898754 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  26.45 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.45445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>