More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4531 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  94.94 
 
 
257 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5014  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  81.18 
 
 
256 aa  370  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5069  extracellular solute-binding protein family 3  59.68 
 
 
253 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  57.69 
 
 
260 aa  278  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7393  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  51.91 
 
 
261 aa  242  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  47.56 
 
 
263 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  46.12 
 
 
261 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  47.69 
 
 
257 aa  205  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  44.18 
 
 
268 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  44.06 
 
 
258 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  47.62 
 
 
257 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.61 
 
 
268 aa  201  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.14 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  45.56 
 
 
268 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1262  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.8 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6175  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0488748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6570  extracellular solute-binding protein  42.68 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  44.8 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  44.57 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.12 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  44.19 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  46.02 
 
 
260 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.12 
 
 
260 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 
267 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  43.73 
 
 
267 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.19 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.02 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.87 
 
 
262 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
261 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  44.44 
 
 
262 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.43 
 
 
260 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  43.43 
 
 
260 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.43 
 
 
260 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
260 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
260 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  44.44 
 
 
260 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.44 
 
 
260 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  44.44 
 
 
260 aa  192  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.02 
 
 
253 aa  191  8e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.02 
 
 
253 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.26 
 
 
260 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 
250 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  43.02 
 
 
253 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.3 
 
 
260 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.56 
 
 
250 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  43.11 
 
 
250 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  43.83 
 
 
260 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5004  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.49 
 
 
257 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  40.87 
 
 
258 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.3 
 
 
260 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.82 
 
 
260 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0179055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.47 
 
 
257 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  40.93 
 
 
256 aa  184  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2043  extracellular solute-binding protein family 3  44.44 
 
 
260 aa  184  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  41.94 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  41.94 
 
 
259 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.76 
 
 
257 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.52 
 
 
257 aa  182  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.53 
 
 
260 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.3 
 
 
260 aa  181  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.91 
 
 
260 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.62 
 
 
260 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  42.59 
 
 
263 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.22 
 
 
258 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  41.13 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.15 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  38.22 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.37 
 
 
257 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  40.46 
 
 
253 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.76 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  41.76 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.76 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.19 
 
 
262 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  42.29 
 
 
255 aa  178  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 
264 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 
265 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.49 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3207  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 
263 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.53 
 
 
258 aa  175  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 
255 aa  175  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.6 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0016  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.62462  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.04 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  42.31 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  41.45 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.35 
 
 
261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>