More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2235 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  91.79 
 
 		 268 aa  517  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  83.58 
 
 		 268 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  82.84 
 
 		 282 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  71.7 
 
 		 265 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  70.89 
 
 		 261 aa  371  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  61.65 
 
 		 260 aa  337  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  60.38 
 
 		 258 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  58.11 
 
 		 257 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  58.85 
 
 		 257 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0945  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  89.86 
 
 		 177 aa  278  7e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.656461  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.83 
 
 		 257 aa  248  5e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.63 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  50.63 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  48.44 
 
 		 257 aa  245  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  47.64 
 
 		 253 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  48.74 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  50.86 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  48.68 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  48.71 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  47.45 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  49.17 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  44.88 
 
 		 258 aa  219  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  49.17 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.37 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  44.7 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  48.52 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  44.79 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  46.69 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  46.4 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  46.48 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  51.08 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  51.08 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1429  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  46 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0594365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.72 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  46 
 
 		 261 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  43.72 
 
 		 250 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  43.29 
 
 		 250 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.58 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5069  extracellular solute-binding protein family 3  47.79 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  43.49 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  42.75 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  42.67 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.25 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3207  extracellular solute-binding protein  45.26 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.06 
 
 		 258 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  44.26 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  44.67 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  44.87 
 
 		 250 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  44.7 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  43.41 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  41.43 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.02 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  43.48 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  46.38 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  43.04 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1094  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.4 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382529  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  40.87 
 
 		 294 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 		 267 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.15 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1240  amino acid binding protein  42.92 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13990  putative amino acid ABC transporter  42.92 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258104  normal  0.0183711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4485  extracellular solute-binding protein family 3  35.27 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  38.37 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1826  arginine/ornithine ABC transporter, periplasmic arginine/ornithine-binding protein  45.38 
 
 		 258 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3571  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  44.19 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.820005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.7 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.7 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6436  extracellular solute-binding protein family 3  36.75 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.61 
 
 		 258 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 		 305 aa  178  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  40.68 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.95 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  41.41 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  41.98 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.58 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.2 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  38.2 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.2 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  42.97 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  41.77 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6191  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.89 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.09 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5014  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  46.22 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 277 aa  168  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001573  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  37.78 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.74719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  38.37 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  40.89 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1829  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.68 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546299  normal  0.360728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>