More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5069 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5069  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
253 aa  520  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  60.64 
 
 
257 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  59.68 
 
 
257 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5014  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  61.64 
 
 
256 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  53.22 
 
 
260 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7393  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  48 
 
 
261 aa  223  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  49.55 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  46.96 
 
 
268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  47.79 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  47.79 
 
 
268 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  46.43 
 
 
260 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  45.45 
 
 
257 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
261 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  44.66 
 
 
257 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  40.71 
 
 
258 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  43.2 
 
 
265 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.31 
 
 
253 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.31 
 
 
253 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.86 
 
 
257 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  45.76 
 
 
267 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1262  extracellular solute-binding protein  42.98 
 
 
270 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6570  extracellular solute-binding protein  42.98 
 
 
270 aa  185  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6175  extracellular solute-binding protein  42.98 
 
 
270 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0488748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  45.76 
 
 
267 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  45.1 
 
 
259 aa  184  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.86 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 
253 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.49 
 
 
267 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  39.69 
 
 
258 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 
261 aa  178  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.16 
 
 
250 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.52 
 
 
260 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
248 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
250 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.56 
 
 
258 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
253 aa  174  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  41.25 
 
 
258 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  41.95 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  41.95 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  42.62 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.92 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  40.7 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2858  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.03 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  42.19 
 
 
259 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1343  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.908604  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02234  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212497  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3449  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  40.34 
 
 
265 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.98 
 
 
261 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2603  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02194  hypothetical protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2465  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2687  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2459  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  40.77 
 
 
260 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  42.06 
 
 
263 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2704  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.6 
 
 
260 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1473  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.76 
 
 
259 aa  169  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2541  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.6 
 
 
260 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.863466  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2583  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.6 
 
 
260 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.17472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2495  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.6 
 
 
260 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.89405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2595  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.6 
 
 
260 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473996  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.1 
 
 
261 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.98 
 
 
257 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.21 
 
 
261 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  40.32 
 
 
257 aa  168  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2790  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.37 
 
 
259 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.239509  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.64 
 
 
257 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  40.4 
 
 
258 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
263 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1566  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.61 
 
 
264 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1429  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.67 
 
 
261 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0594365  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  38.36 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2917  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  41.3 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.831114 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  38.52 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  39.91 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.84 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2568  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.82 
 
 
259 aa  161  9e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  42.44 
 
 
263 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 
255 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1094  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.44 
 
 
258 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382529  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.08 
 
 
257 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.85 
 
 
250 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  40.85 
 
 
250 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 
250 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 
265 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1538  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.46 
 
 
260 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.3 
 
 
265 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1428  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  38.46 
 
 
260 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.35 
 
 
260 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0353  histidine ABC transporter periplasmic histidine-binding protein  38.46 
 
 
302 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.468361  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  38.7 
 
 
257 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  37.74 
 
 
258 aa  158  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>