More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1928 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
265 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
258 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  42.8 
 
 
250 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  42.8 
 
 
250 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  42.8 
 
 
250 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  40.8 
 
 
254 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  41.53 
 
 
260 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 
263 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.4 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  41.02 
 
 
248 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.8 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  45.06 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  45.06 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.6 
 
 
254 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  43.04 
 
 
268 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 
250 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  41.25 
 
 
263 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  42.15 
 
 
268 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  39.44 
 
 
258 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  42.8 
 
 
250 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  40.39 
 
 
258 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.86 
 
 
259 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  39.84 
 
 
258 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001573  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  40 
 
 
247 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.74719  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05529  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  39.59 
 
 
247 aa  186  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  37.35 
 
 
243 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  37.35 
 
 
243 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.11 
 
 
243 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.02 
 
 
261 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.93 
 
 
261 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.8 
 
 
249 aa  185  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.35 
 
 
243 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.4 
 
 
244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1429  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.78 
 
 
261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0594365  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0700  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  38.59 
 
 
243 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.347684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1094  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.08 
 
 
258 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382529  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  39.68 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4485  extracellular solute-binding protein family 3  38.2 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  37.9 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  37.9 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  37.9 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  37.9 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.43 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  37.9 
 
 
243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  43.24 
 
 
257 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.54 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  38.43 
 
 
243 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 
305 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.1 
 
 
261 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4365  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
264 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  41.09 
 
 
263 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1113  extracellular solute-binding protein  43.59 
 
 
252 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.264301  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  39.02 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.54 
 
 
258 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  39.56 
 
 
243 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  39.56 
 
 
243 aa  178  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  39.56 
 
 
243 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.38 
 
 
250 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.8 
 
 
244 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  40.54 
 
 
259 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
250 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6436  extracellular solute-binding protein family 3  36.96 
 
 
268 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00118461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.6 
 
 
243 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 
250 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  40.95 
 
 
250 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  41.1 
 
 
261 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4841  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 
259 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.608491  normal  0.182351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.98 
 
 
260 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6800  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 
259 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8606  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4286  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 
259 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0413144  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.96 
 
 
243 aa  175  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  39.24 
 
 
277 aa  175  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  40.38 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  39.77 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.89 
 
 
243 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.89 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.89 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  35.89 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.89 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.89 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.89 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.89 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  35.89 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 
280 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  39 
 
 
257 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1240  amino acid binding protein  39.92 
 
 
263 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7393  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  37.55 
 
 
261 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
260 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.94 
 
 
243 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1826  arginine/ornithine ABC transporter, periplasmic arginine/ornithine-binding protein  41.7 
 
 
258 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  34.94 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.94 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2071  extracellular solute-binding protein family 3  38.55 
 
 
262 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.012684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.5 
 
 
243 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  34.94 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  38.49 
 
 
256 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.94 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.94 
 
 
243 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13990  putative amino acid ABC transporter  39.5 
 
 
263 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.258104  normal  0.0183711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>