More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6395 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6395  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
257 aa  524  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.45445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4531  extracellular solute-binding protein family 3  94.94 
 
 
257 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.417135  normal  0.112125 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5014  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  81.18 
 
 
256 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5069  extracellular solute-binding protein family 3  60.64 
 
 
253 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0175  extracellular solute-binding protein  56.84 
 
 
260 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42214 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7393  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  52.77 
 
 
261 aa  243  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  49.2 
 
 
257 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  44.58 
 
 
268 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  47.29 
 
 
261 aa  208  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  48 
 
 
263 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  48.22 
 
 
257 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  44.06 
 
 
258 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44.35 
 
 
268 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.74 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  45.74 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 
267 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  45.74 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  46.46 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.26 
 
 
282 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  45.35 
 
 
267 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  43.95 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1262  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6570  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6175  extracellular solute-binding protein  43.53 
 
 
270 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0488748 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.73 
 
 
262 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.53 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.8 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.53 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  44.8 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.3 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  45.3 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  45.3 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  45.3 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.3 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.3 
 
 
260 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.06 
 
 
260 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  42.91 
 
 
260 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.91 
 
 
260 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.91 
 
 
260 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2808  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 
250 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3780  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.68 
 
 
260 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.73 
 
 
260 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  44 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.02 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  44 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.02 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  44.79 
 
 
257 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  43.56 
 
 
250 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  44.26 
 
 
260 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3710  extracellular solute-binding protein  43.02 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33118  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2043  extracellular solute-binding protein family 3  45.3 
 
 
260 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000188394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  44.83 
 
 
260 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0179055 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  41.31 
 
 
256 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5004  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  45.1 
 
 
257 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  45.22 
 
 
263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  41.54 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.3 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  41.94 
 
 
259 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.86 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  41.94 
 
 
259 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  40.47 
 
 
265 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.77 
 
 
257 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3739  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.53 
 
 
260 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40213  normal  0.421075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5565  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.3 
 
 
260 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857563  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  38.82 
 
 
258 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4902  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  42.91 
 
 
260 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.463911  decreased coverage  0.0000475761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.35 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  43.25 
 
 
255 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5139  extracellular solute-binding protein  42.19 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.900284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  41.67 
 
 
258 aa  178  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.19 
 
 
262 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3685  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.76 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304708  normal  0.133024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.27 
 
 
260 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4522  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  41.76 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  39.69 
 
 
253 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3842  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.76 
 
 
260 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 
258 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  40.91 
 
 
258 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  39.62 
 
 
257 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4841  extracellular solute-binding protein  39.61 
 
 
259 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.608491  normal  0.182351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1368  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 
259 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.63 
 
 
260 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.42 
 
 
259 aa  175  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 
255 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
261 aa  174  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  42.74 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4286  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0413144  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  41.45 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  37.93 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>